Ekeliden startades 1923 av syster Hulda Englund och var då ett hem för utvecklingsstörda barn. På 1950-talet bodde 105 barn i huvudbyggnaden och ytterliggare några i arbetshemmet som idag kallas Annexet. Det var en tid då barn med funktionshinder ofta lämnades bort som små och som sedan levde sina liv på institutioner.
Syster Huldas brorsdotter Stina Åslund, gift Benesi, övertog Ekeliden efter Syster Huldas död år 1952. Syster Stina bildade 1974 Syster Hulda Englunds stiftelse Ekeliden. På 1970-talet kom en ny lagstifning och barnen på Ekeliden flyttades till sina hemkommuner. Ekelidens nya boendekategori blev personer över 18 år.
Efter detta har Ekeliden byggts om allt efter gällande lagstifning. Upptagningsområdet är idag hela Sverige.
Verksamheten bedrevs av Stiftelsen fram till år 2013 då den övertogs av Humana Ekeliden AB